Biyomedikal Mühendisliği Enstitüsü

Eğitim:

Yüksek Lisans: Marmara Üniversitesi (Tıp Fakültesi), 1990.

Doktora: Drexel Üniversitesi, 1997.

Deneyim:

Prof. Dr. Cengizhan Öztürk, 1997-2000 yılları arasında Johns Hopkins Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği Bölümü Tıbbi Görüntüleme Laboratuvarı'nda doktora sonrası araştırma görevlisi olarak çalıştı. 1999-2000 yılları arasında ayrıca Ulusal Kalp, Akciğer ve Kan Enstitüsü (NHLBI, NIH) Kalp Enerjisi Laboratuvarı'nda çalıştı. Prof. Öztürk yüksek lisans ve doktora çalışmalarında her zaman manyetik rezonans görüntüleme alanındaki çeşitli konulara odaklanmıştır. 2000 yılında Boğaziçi Üniversitesi'nde çalışmaya başlamış, daha sonra 2003 ile 2005 yılları arasında MR kılavuzlu tıbbi müdahaleler üzerine çalışmak üzere NIH'ye bağlı NHLBI'nin Kardiyak Girişim Laboratuvarı'nı misafir araştırmacı olarak ziyaret etmiştir. Halen Boğaziçi Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği Enstitüsü'nde Profesör olarak görev yapmaktadır.

Araştırma Alanları:

Manyetik Rezonans Görüntüleme (MRG); Girişimsel MRG; Görüntü Kılavuzlu Tıbbi Girişimler; MR-Anjiyo Füzyonu (XFM); Kardiyak Görüntüleme (özellikle Kardiyak MRG); Kardiyak Fizyoloji; Kardiyovasküler Modelleme; Nörogörüntüleme (özellikle Nöro MRG); Tıbbi Görüntü İşleme; Görüntü Kayıt ve Görselleştirme.

Haberler/Öne Çıkanlar:

Dr. Öztürk, 1990 yılında İstanbul'daki Marmara Tıp Fakültesi'nden tıp doktoru unvanını almıştır. Daha sonra 1994 yılında İstanbul'daki Cerrahpaşa Tıp Fakültesi'nde Fizyoloji Uzmanlık Derecesi ve 1997 yılında Philadelphia'daki Drexel Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği, Bilim ve Sağlık Sistemleri Fakültesi'nde doktora derecesini almıştır. Tez konusu, nesnelerin 3D yüzey görüntülerini elde etmek ve bunları hizalamak için daha iyi yöntemler bulmak amacıyla yeni bir 3D bilgisayar görme tekniğinin (Perfect Submap tabanlı Yapısal Işık) geliştirilmesine odaklanmıştır. 1997-2000 yılları arasında Johns Hopkins Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği Bölümü Tıbbi Görüntüleme Laboratuvarı'nda doktora sonrası araştırma görevlisi olarak çalışmıştır. 1999-2000 yılları arasında, Ulusal Kalp, Akciğer ve Kan Enstitüsü (NHLBI, NIH) Kalp Enerjisi Laboratuvarı'nda da çalışmıştır. Yüksek lisans ve doktora çalışmaları her zaman Manyetik Rezonans Görüntüleme alanındaki çeşitli konulara odaklanmıştır. 2000 yılında Boğaziçi Üniversitesi'nde çalışmaya başlamış, daha sonra 2003 ile 2005 yılları arasında MR kılavuzlu tıbbi müdahaleler üzerine çalışmak üzere NIH'ye bağlı NHLBI'nin Kardiyak Girişim Laboratuvarı'nı misafir bilim insanı olarak ziyaret etmiştir. Halen Boğaziçi Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği Enstitüsü'nde Profesör olarak görev yapmaktadır.

Dr. Öztürk, Boğaziçi Üniversitesi Tıbbi Görüntüleme Laboratuvarı’nın (BUMIL) koordinatörüdür. BUMIL, manyetik rezonans görüntülemeye yoğun bir şekilde odaklanan ve ağırlıklı olarak girişimsel, kardiyak ve nöro-MRG alanlarında çalışan çok disiplinli bir araştırma laboratuvarıdır. Laboratuvarın genel amacı, kantitatif ve fonksiyonel görüntüleme ihtiyacı olan tüm biyolojik ve tıbbi alanlarda, temel sinyal işleme görevlerinden spesifik görüntü işleme yazılımı geliştirmeye kadar uzanan geniş bir yelpazede biyomedikal araştırmalar yürütmektir. BUMIL, 2001 yılının sonlarında Siemens Healthcare Solutions Türkiye'nin sağladığı mütevazı bir başlangıç hibesi ile kurulmuştur. 2008 yılının sonuna kadar, örnek bir üniversite-endüstri işbirliği projesi yürütülmüştür. Siemens ve BUMIL arasındaki bu işbirliğinin bileşenleri şunlardı: öğrenci bursları, öğrenci seyahat hibeleri, Siemens tarayıcılarına teknik erişim, birkaç referans görüntüleme merkezinde (İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi ve Acıbadem Hastanesi) desteklenen teknik araştırmalar. UMRAM’ın (Ulusal Manyetik Rezonans Araştırma Merkezi) kurulmasıyla birlikte, Siemens ile daha resmi ve kapsamlı işbirlikleri artık Bilkent Üniversitesi’ndeki UMRAM aracılığıyla yürütülmektedir. Dr. Öztürk, UMRAM’ın Ulusal Yönetim Kurulu üyesidir.

Dr. Cengizhan Öztürk, Boğaziçi Üniversitesi’nde “Mikro Sistem Tabanlı Tıbbi Cihaz Geliştirme Laboratuvarı” adlı çok disiplinli bir araştırma ekibine liderlik etmektedir. Bu laboratuvar, Devlet Planlama Teşkilatı tarafından üçlü proje konsorsiyumu aracılığıyla finanse edildiği 2008 yılının ocak ayında, “Yaşam Bilimleri ve Teknolojileri Merkezi” resmi adıyla daha sağlam bir yapıya kavuşmuştur. (http://lifesci.boun.edu.tr) Orijinal LifeSci modülleri (DeviceLab, Sistem Biyolojisi ve Vivarium) iki yeni modül ile genişletilmiştir: a) Akıllı İlaçlar, b) Hesaplamalı Biyoloji ve Biyoinformatik. Merkez, 10 farklı bölümden 40'ın üzerinde akademisyen tarafından desteklenmektedir. Vivarium şu anda tam olarak faaliyete geçmiştir ve benzersiz MEMS ile tıbbi cihaz üretim kapasitelerini tek çatı altında birleştiren 250 m²'lik Temiz Oda, 2011 sonbaharında sertifikalandırılmıştır. Devam eden bu merkez projesi için ayrılan toplam bütçe şu anda yaklaşık 9.500.000 $'dır. Mayıs 2011'de Dr. Öztürk, Yaşam Bilimleri ve Teknolojileri Merkezi'nin direktörü olarak atanmıştır.

Dr. Öztürk, Yaşam Bilimleri ve Teknolojileri Merkezi çevresindeki endüstriyel işbirliğini genişletmeye yönelik yeni bir finansman girişimine de öncülük etmektedir. İstanbul Üniversitesi ve Sabancı Üniversitesi ile bir konsorsiyum oluşturularak, Yaşam Bilimleri ve Teknolojileri için İstanbul İşbirliği Platformu (INOVİTA) kurulmuştur. (http://www.inovita.org) İnovita kurulmuş ve İstanbul Bölgesel Kalkınma Ajansı’ndan (ISTKA) yaklaşık 900.000 dolarlık bir başlangıç fonu almıştır. Proje, 2011 yılının Temmuz ayı sonunda başlamıştır.

Araştırma Projeleri:

  • Yaşam Bilimleri ve Teknolojileri Uygulama ve Araştırma Merkezi, Fon Sağlayıcı Kurum: Devlet Planlama Teşkilatı, Proje No: 2009K120520, Merkez Direktörü ve Mikro Sistem Tabanlı Tıbbi Cihaz Geliştirme Birimi Koordinatörü: Doç. Dr. Cengizhan Öztürk (BU BME). Proje 1/2008 tarihinde başlamıştır, tahmini bitiş tarihi:bilinmemektedir, ayrılan bütçe yaklaşık 9.000.000 $'dır.

  • İstanbul Yaşam Bilimleri ve Teknolojileri İşbirliği Platformu, Proje Koordinatörü: Doç. Dr. Cengizhan Öztürk (BU BME), proje 7/2011'de başlayacak, tahmini bitiş tarihi: 7/2012, Bütçe: yaklaşık 900.000 $, Fon Sağlayıcı Kurum: ISTKA, İstanbul Kalkınma Ajansı.

  • 2011-devam ediyor: (AB 7. Çerçeve COST ACTION) Demansta Arteriyel Spin Etiketleme Girişimi (AID), PI: Prof. Xavier GOLAY (University College London), Boğaziçi Üniversitesi'nden katılımcılar: Cengizhan Ozturk, Onur Ozyurt, Bütçe: Müzakere aşamasında.

  • 2011-devam ediyor: (AB 7. Çerçeve MARIE CURIE ACTION) TAHITI (Görüntüleme Yoluyla Terapi ve Müdahalenin İyileştirilmesi), PI: María J. Ledesma Carbayo (Madrid Politeknik Üniversitesi), Araştırmacı: Cengizhan Ozturk, Bütçe: Müzakere aşamasında.

  • 2011-devam ediyor: (Boğaziçi Üniversitesi Araştırma Fonu) Çift Enerjili Göğüs Röntgeni Sisteminin Geliştirilmesi, PI: Cengizhan Öztürk, Bütçe: 20.000 USD.

  • 2010-devam ediyor: San-Tez (Sanayi ve Ticaret Bakanlığı, Türkiye Cumhuriyeti), Dijital Taşınabilir Diş Röntgeni, Proje Sorumlusu: Cengizhan Öztürk, Ortak Şirket: DDRLINE. Bütçe: 200.000 $.

  • Girişimsel MRG'de Otomatik Kateter Yerelleştirme için Yeni Bir Entegre Optoelektronik Sistem, TUBITAK, Proje No: 108E119, PI: Doç. Dr. Arda. Yalcinkaya (BU EE), Araştırmacılar: Cengizhan Ozturk ve Senol Mutlu (BU EE), başlangıç tarihi: 10/2008, tahmini bitiş tarihi: 10/2011 (kapanış aşamasında), Bütçe: 458.238 TL.

  • TUBITAK-HELMHOLTZ Mobilite ve Öğrenci Bursları için Ortak Fon. Proje Başlığı: Tümör Perfüzyon Ölçümleri: 7 Tesla'da Tek Atışlı 3D GRASE Okuma ile Sözde Sürekli Arteriyel Spin Etiketleme, DKFZ, Almanya'daki Proje Sorumlusu: Prof. M. Bock. BU'daki Proje Sorumlusu: Doç. Dr. C. Öztürk. Süre: 2009-2011 yılları arasında 24 ay (kapanış aşamasında), Bütçe: yaklaşık 20.000 €.

  • TAM: Bilgi ve İletişim Teknolojileri Alanında Araştırmacı ve Akademisyen Yetiştirme Merkezi Projesi (TAM), Fon Sağlayıcı Kurum: Devlet Planlama Teşkilatı, Proje No: 2007K120610, Baş Araştırmacı: Prof. Ufuk Çağlayan (BU Bilgisayar Mühendisliği), Araştırmacı: Doç. Prof. C. Ozturk, proje başlangıç tarihi: 1/2007, tahmini bitiş tarihi: 12/2012, Bütçe: yaklaşık 4.000.000 $.

Yayınlar:

Son Yayınlar (Son 3 Yıl)

  • Dinçer, O. Özyurt, D. Kaya, E. Koşak, C. Ozturk, C. Erzen, M. N. Pamir, “Diffusion Tensor Imaging of Guillain-Mollaret Triangle in Patients with Hypertrophic Olivary Degeneration”, Journal of Neuroimaging, 21:145-151, 2011.

  • S. Isci, C. Ozturk, J. Jones, H. H. Otu, “Pathway Analysis of High-Throughput Biological Data within a Bayesian Network Framework”, Bioinformatics, 27(12): 1667-1674, 2011.

  • H. Saybasili, J. A. Derbyshire, P. Kellman, M. A. Griswold, C. Ozturk, R. J. Lederman, N. Seiberlich, “RT-GROG: Parallelized Self-Calibrating GROG for Real-Time MRI”, Magnetic Resonance in Medicine, 64: 306-312, 2010.

  • H. Saybasili, A. Z. Faranesh, C. E. Saikus, C. Ozturk, R. J. Lederman, M. A. Guttman, “Interventional MRI Using Multiple 3D Angiography Roadmaps with Real-Time Imaging”, Journal of Magnetic Resonance Imaging, 31: 1015-1019, 2010.

  • K. Aydin, O. Ozmen-Okur, B. Tatli, S. G. Sarwar, C. Ozturk, C. Dilber, “Reduced Gray Matter Volume in the Frontotemporal Cortex of Patients with Early Subacute Sclerosing Panencephalitis”, American Journal of Neuroradiology, 30: 271-75, 2009.

  • O. Kocaturk, C. E. Saikus, M. A. Guttman, A. Z. Faranesh, K. Ratnayaka, C. Ozturk, E. R. McVeigh, R. J. Lederman, “Whole Shaft Visibility and Mechanical Performance for Active MRI Catheters Using Copper-Nitinol Braided Polymer Tubes”, Journal of Cardiovascular Magnetic Resonance, 11: 29, 2009. (doi:10.1186/1532-429X-11-29)

  • O. Kocaturk, A. H. Kim, C. Saikus, M. A. Guttman, A. Z. Faranesh, C. Ozturk, R. J. Lederman, “An Active Two Channel 0.035” Guidewire for Interventional Cardiovascular MRI”, Journal of Magnetic Resonance Imaging, 30: 461-465, 2009.

  • K. Ratnayaka, V. K. Raman, A. Z. Faranesh, M. Sonmez, J. H. Kim, L. F. Gutiérrez, C. Ozturk, E. R. McVeigh, M. C. Slack, R. J. Lederman, “Antegrade Percutaneous Closure of Membranous Ventricular Septal Defect using X-Ray Fused with MRI (XFM)”, JACC: Cardiovascular Interventions, 2 (3): 224-230, 2009.

  • J.H. Kim, O. Kocaturk, C. Ozturk, A. Z. Faranesh, M. Sonmez, S. Sampath, C. E. Saikus, A. H. Kim, V. K. Raman, J. A. Derbyshire, W. H. Schenke, V. J. Wright, C. Berry, E. R. McVeigh, R. J. Lederman, “Mitral Cerclage Annuloplasty, A Novel Transcatheter Treatment for Secondary Mitral Valve Regurgitation, Initial Results in Swine”, JACC, 54( 7): 638-51, 2009.

Akademik Web Sayfası:

https://bumil.bogazici.edu.tr/

Dersler:

  • BM 501: Biology of Living Systems
  • BM 502: Introduction to Medical Physiology
  • BM 688: Special Studies (MRI: Advanced Topics)
  • BM 573: Cardiovascular Imaging