Biyomedikal Mühendisliği Enstitüsü
Özgeçmiş:
Dr. Emine Sümeyra Turalı-Emre, 2024 yılında Boğaziçi Üniversitesi’ne katıldı ve burada nanoteknoloji, biyomedikal mühendisliği ve veri bilimi alanlarındaki uzmanlığını birleştirerek sağlık hizmetlerindeki kritik sorunların çözümüne katkıda bulunuyor. Araştırmaları, ilaç ve gen aktarımı, antibakteriyel ve kanser tedavileri, kemik rejenerasyonu ve teşhis amaçlı hücre dışı vezikül yakalama gibi uygulamalar için inorganik nanopartiküllerin geliştirilmesine odaklanmaktadır.
Dr. Turalı-Emre, akademik yolculuğuna İstanbul Üniversitesi'nde Moleküler Biyoloji ve Genetik alanında lisans derecesi alarak başlamıştır. Ardından, Dr. Utkan Demirci'nin danışmanlığında Harvard Tıp Fakültesi ve MIT'ye araştırma görevlisi olarak katılmış ve doku mühendisliği, kanser modeli geliştirme ve kök hücre niş tasarımı alanlarında çığır açan çalışmalara katkıda bulunmuştur. Michigan Üniversitesi'nde Biyomedikal Mühendisliği alanında yüksek lisans ve doktora derecelerini tamamlamış ve burada Dr. Nicholas A. Kotov'un danışmanlığında yenilikçi araştırmalar yürütmüştür. Doktora tezi olan “Biyomedikal Uygulamalar için Biyomimetik Nanopartiküllerin Mühendisliği”, DNA ve ilaç dağıtımı için nanopartiküllerin tasarımını araştırmış ve bunların terapötik potansiyeli hakkında temel bilgiler sağlamıştır. Dr. Turalı-Emre, araştırmalarına Michigan Üniversitesi'nde Kimya Mühendisliği alanında doktora sonrası araştırmacı olarak devam etmiş ve burada ileri tanı ve tedavi yöntemleri için kiral inorganik nanopartiküller tasarlamıştır. Michigan Üniversitesi Tıp Fakültesi'nden Dr. Scott VanEpps ile işbirliği içinde, MRSA dahil olmak üzere biyofilmler ve antibiyotiğe dirençli bakterilerle mücadele etmek için nanopartikül sistemleri geliştirmiştir. Doktora sonrası araştırmaları, nanopartikül-protein etkileşimlerinin ve çok ölçekli kiral özelliklerin hesaplamalı modellemesini de içermektedir. Boğaziçi Üniversitesi'ne katıldıktan sonra, Michigan Üniversitesi ile misafir araştırmacı olarak işbirliğini sürdürerek, hücre dışı vezikül yakalama cihazlarının tasarımı, biyofilmlerden RNA izolasyonunun optimizasyonu ve kiral nanopartiküller kullanarak antibakteriyel yüzeylerin geliştirilmesine odaklanan Coulter Translational Research Partnership projelerine katkıda bulunmaktadır. Dr. Turalı-Emre’nin çalışmaları Advanced Materials, Matter ve PNAS gibi önde gelen dergilerde yer almış, Advanced Materials dahil olmak üzere birçok yayını dergi kapaklarında öne çıkarılmıştır. Sigma Xi Bilimsel Araştırma Onur Derneği üyesidir ve BioInterfaces Araştırma Topluluğu Yenilikçi Ödülü dahil olmak üzere birçok ödüle layık görülmüştür.
Disiplinlerarası işbirliğini ve DEI'yi (çeşitlilik, eşitlik ve kapsayıcılık) geliştirmeye tutkulu olan Dr. Turalı-Emre, mühendislik, yaşam bilimleri ve bilgisayar bilimleri dahil olmak üzere çeşitli alanlardan lisans, yüksek lisans ve geleneksel olmayan öğrencileri laboratuvarına katılmaya davet etmektedir. Laboratuvarı, etkili araştırmalar yürütmek ve sağlık hizmetlerinde dönüştürücü yeniliklere katkıda bulunmak için canlı bir ortam sunmaktadır.
Eğitim:
- Fast Forward Medical Innovation FastPace Programı, Michigan Üniversitesi, 2024
- Doktora, Biyomedikal Mühendisliği, Michigan Üniversitesi, 2021 Tez: Biyomedikal Uygulamalar için Biyomimetik Nanopartiküllerin Mühendisliği
- Translasyonel Araştırma Eğitim Sertifikası
- Yüksek Lisans, Biyomedikal Mühendisliği, Michigan Üniversitesi, 2015
- Lisans, Moleküler Biyoloji ve Genetik, İstanbul Üniversitesi, 2008
Deneyim:
- Yardımcı Doçent, Biyomedikal Mühendisliği Enstitüsü, Boğaziçi Üniversitesi, 2024–Günümüz İlaç dağıtımı, antibakteriyel tedaviler ve yapay zeka destekli nanopartikül tasarımı dahil olmak üzere sağlık uygulamaları için nanoteknoloji alanında araştırmalara öncülük etmektedir.
- Misafir Araştırmacı, Michigan Üniversitesi, 2024Hücre dışı vezikül yakalama, biyofilmlerden RNA izolasyonunun optimize edilmesi ve kiral nanopartiküller kullanarak antibakteriyel yüzeylerin geliştirilmesine odaklanan Coulter Translational Research Partnership projelerine katkıda bulunmuştur.
- Doktora Sonrası Araştırma Görevlisi, Kimya Mühendisliği, Michigan Üniversitesi, 2021–2024Gelişmiş tanı ve tedavi yöntemleri için kiral inorganik nanopartiküller tasarlamıştır. Michigan Üniversitesi Tıp Fakültesi ile biyofilmler ve antibiyotiğe dirençli bakteriler için antibakteriyel nanoparçacık araştırmalarında işbirliği yaptı.
- Yüksek Lisans Araştırma Asistanı, Biyomedikal Mühendisliği, Michigan Üniversitesi, 2015–2021 İlaç ve DNA iletimi için nanoparçacık sentezini araştırdı. Disiplinlerarası işbirliklerini yönetti ve lisans öğrencisi araştırmacılara danışmanlık yaptı.
- Yüksek Lisans Araştırmacısı, Biyomedikal Mühendisliği, Michigan Üniversitesi, 2012–2015Biyomedikal uygulamalar için nanopartikül sentezini ve bunun boyut, şekil ve yük üzerindeki etkisini araştırdı.
- Araştırma Görevlisi, Harvard Tıp Fakültesi ve MIT, 2008–2010Mesan dokusu tasarladı, kanser modelleri geliştirdi ve kök hücre nişleri oluşturdu.
Araştırma Alanları:
Kiral nanopartiküller, antibakteriyel nanopartiküller, hücre dışı vezikül yakalama, yapay zeka odaklı nanopartikül-protein etkileşimleri, ilaç ve gen taşıma sistemleri, kanser tedavileri, translasyonel nanoteknoloji ve biyomedikal zorlukları ele almak için disiplinlerarası yaklaşımlar
Ödüller:
- BioInterfaces Araştırma Topluluğu Yenilikçi Ödülü, 2024
- Sigma Xi Bilimsel Araştırma Onur Derneği Tam Üyesi, 2024
- Women in Science and Engineering, Cinda Sue Davis STEM Eşitlik Liderlik Ödülü (Aday), 2024
- Bilim ve Mühendislikte Kadınlar, Willie Hobbs Moore Başarı Ödülü (Aday), 2024
- Seçilmiş Katılımcı, Bilim ve Mühendislikte Yapay Zeka Yaz Akademisi, 2023
- Ödül Kazanan, 1 Yıllık Üyelik, Amerikan Bilim İlerleme Derneği (AAAS), 2021
- Onur Ödülü, İleri Düzey Lisansüstü Araştırma Yarışması, UM Mühendislik Araştırma Sempozyumu, 2021
- Nano Scribe Bursiyeri, Tıp için Mikro-Nanoteknolojiler Konferansı, 2019
- U-M Mühendislik Fakültesi Dergisinde Yer Aldı (6 sayfalık makale), 2019
- Kuzey Kampüsü Dekanları Martin Luther King Ruhu Ödülü (Aday), 2019
- Tam Burs, Türkiye Milli Eğitim Bakanlığı (Doktora ve Yüksek Lisans çalışmaları), 2011–2019
- Finalist, Kadın Mühendisler Derneği Üniversite Araştırma Yarışması (WE18), 2018
- En İyi Araştırma Posteri, Biyolojik Bilimler, Michigan Mikroskopi ve Mikroanaliz Derneği Yıllık Toplantısı, 2017
- Yüksek Lisans Öğrencisi Spot Işığı, UM Kadın Mühendisler Yüksek Lisans Derneği, 2017
- Birincilik Ödülü, Doku ve Hücre Biyolojisi Oturumu, UM Mühendislik Yüksek Lisans Sempozyumu, 2016
Araştırma Projeleri:
Şu anda Dr. Turalı-Emre, Veri Bilimi ve Yapay Zeka Enstitüsü'nden Dr. Betül Özateş ile işbirliği içinde bir TÜBİTAK-BİLGEM projesini yönetmektedir. İkili, nanoteknoloji ile yapay zekayı birleştirerek, teşhis ve tedaviler için antibakteriyel nanopartikülleri optimize etmek amacıyla yapay zeka destekli bir veritabanı geliştirmektedir.
Yayınlar:
Seçilmiş Yayınlar
-
McGlothin, C. N., Whisnant, K. G., Turalı-Emre, E. S., & Kotov, N. A. Coupled self-replication and self-assembly of inorganic nanoparticles into biosimilar networks. Matter (2024, in press).
-
Kang, Y. T., Kim, J. Y., Turalı-Emre, E. S., Jang, H. J., Cha, M., Kumari, A., Palacios-Rolston, C., Subramanian, C., Purcell, E., Owen, S., Lim, C. M., Reddy, R., Jolly, S., Ramnath, N., Nagrath, S., & Kotov, N. A. Chiroptical detection and mutation analysis of cancer-associated extracellular vesicles in microfluidic devices. Matter 2024, 10.1016/j.matt.2024.09.005.
-
Yao, H., Fan, Y., Turalı-Emre, E. S., Li, N., Ge, M., Wang, J., & Wei, J. Enhancing antibacterial defense with alginate-modified ZnO nanoparticles against biofilm formation. Int. J. Biol. Macromol. 2024, 280, 1, 10.1016/j.ijbiomac.2024.135739.
-
Cha, M., Ma, J., Kim, J. Y., Turalı-Emre, E. S., & Kotov, N. A. Graph-theoretical chirality measure and chirality–property relations for chemical structures with multiscale mirror asymmetries. Chirality 36, e23678 (2024). 10.1002/chir.23678.
-
Kim, J. Y., McGlothin, C., Cha, M., Pfaffenberger, Z. J., Turalı-Emre, E. S., Choi, W., Kim, S., Biteen, J., & Kotov, N. A. Direct–write printing of plasmonic nanohelicoids by circularly polarized light. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 121, e2312082121 (2024). 10.1073/pnas.2312082121.
-
Gao, R., Xu, X., Kumar, P., Liu, Y., Zhang, H., Guo, X., Sun, M., Colombari, F., De Moura, A., Hao, C., Cha, M., Turalı-Emre, E. S., Ma, J., Xu, L., Kuang, H., Kotov, N. A., & Xu, C. Efficient agglutination of various corona viruses by tapered chiral nanoparticles. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 121, e2310469121 (2024). 10.1073/pnas.2310469121.
-
Turalı-Emre, E. S., Emre, A. E., Vecchio, D. A., Kadiyala, U., VanEpps, S. J., & Kotov, N. A. Self-assembly of iron sulfide nanoparticles into compartmentalized supraparticles as artificial viruses for gene and gene therapies. Adv. Mater. 35, 23 (2023). 10.1002/adma.202211244.
-
Cha, M., Turalı-Emre, E. S., Xiao, X., Kim, J. Y., Bogdan, P., VanEpps, S. J., Violi, A., & Kotov, N. A. Unifying structural descriptors for biological and bioinspired nanoscale complexes. Nat. Comput. Sci. 2, 243–252 (2022). 10.1038/s43588-022-00229-w.
-
Baranwal, M., Magner, A., Saldinger, J., Turalı-Emre, E. S., Elvati, P., Kozaker, S., VanEpps, S. J., Kotov, N. A., Violi, A., & Hero, A. O. Struct2Graph: A graph attention network for structure-based predictions of protein-protein interactions. BMC Bioinformatics 23, 370 (2022). 10.1186/s12859-022-04910-9.
-
Kadiyala, U., Turalı-Emre, E. S., Bahng, J. H., Kotov, N. A., & VanEpps, S. J. Unexpected insights into the antibacterial activity of zinc oxide nanoparticles against methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). Nanoscale 2018, 10.1039/C7NR08499D.
Hakem:
Frontiers in Molecular Biosciences
E posta:
eminesumeyra.turalibogazici.edu.tr , esumeyra@umich.edu
